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NetRD:一种利用Bing搜索结果补充文献挖掘证据集的工具

摘要:目的当前生物文献挖掘工作的重心是改进各挖掘模块性能,以提升挖掘结果的可信度,但有很大比例的挖掘结果其文献证据很少,为此本文提出一个利用Bing搜索引擎从海量Web数据中为文献挖掘得到的生物实体关联对提供补充证据的工具系统。方法利用现有文本挖掘技术从PubMed文献中挖掘一批生物实体关联对,引入BingWeb搜索模块,以生物实体名作为关键词从Web中利用Bing开放搜索API得到一批搜索结果,将这些结果整理成新的数据源,最终从该新的数据源中挖掘得到一批来自Web的补充证据。结果本系统(bioinfo.ustc.edu.cn/NetRD)对文献证据较少的生物实体关联对提供了有效的补充证据支持,丰富了文献挖掘结果最终的证据集。结论以Web数据作为补充数据源,能够有效地为文献证据很少的生物实体对提供证据补充,为相关研究者确认两个生物实体之间的关联提供重要参考。

关键词:
  • 生物文献挖掘  
  • bingwebsearchapi  
  • 证据集  
  • 生物实体关联对  
  • 证据补充  
作者:
邹熊峰; 郑浩然
单位:
中国科学技术大学计算机科学与技术学院; 合肥230027
刊名:
北京生物医学工程

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:北京生物医学工程

北京生物医学工程杂志紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:11-2261/R。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1981年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。

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