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病毒感染海洋球石藻Emiliania huxleyi的转录组分析

摘要:海洋球石藻Emiliania huxleyi及其特异性裂解病毒E.huxleyi virus(EhVs)在调节海洋碳、硫循环及全球气候变化中起着重要作用,也是开展真核生物病毒–宿主相互作用研究的良好模型系统之一。为了探究病毒感染条件下E.huxleyi基因表达水平的变化,以海洋球石藻E.huxley–BOF 92及其专一性裂解病毒EhV-99B1为研究对象,利用Illumina HiSeq 2000高通量测序技术,分别对E.huxleyi病毒感染组(Exp)和非感染对照组(Con)6 h和45 h的藻细胞样品进行转录组测序分析。共得到32909条平均长度为1153 bp的基因。病毒感染6 h和45 h分别得到2617和5229个差异表达基因,其中共差异表达基因465个。随机选取10条差异表达基因,采用qRT-PCR进行实验验证,结果证实转录组分析可靠。GO功能注释和KEGG通路富集,发现大量基因与氧化应激反应、脂类代谢、碳水化合物代谢及信号转导等代谢过程相关,其中变化最显著的是谷胱甘肽代谢途径。从病毒感染球石藻转录组中筛选出部分与氧化应激反应相关的基因,其中9个基因显著上调,11个基因显著下调,表明宿主能够通过体内的氧化应激反应响应病毒胁迫。

关键词:
  • 海洋球石藻emiliania  
  • huxleyi  
  • 病毒感染  
  • 转录组  
  • 差异表达基因  
  • 氧化应激反应  
作者:
田雪; 蔡伟聪; 苏金净; 吴书燕; 刘静雯
单位:
集美大学食品与生物工程学院; 福建厦门361021; 福建省食品微生物与酶工程重点实验室; 福建厦门361021
刊名:
海洋学报

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:海洋学报

海洋学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:11-2055/P。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1979年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。

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