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云南省6种鹅膏菌DNA条形码序列分析

摘要:目的对云南省6种鹤膏菌的核糖体大亚基(nuclear large-subunit ribosomal DNA,nLSU rDNA)及内转录间隔区(internal transcribed spacer,1TS)DNA序列进行比对分析,探究其亲缘关系以找到合适的鉴定鹅膏菌D N A条形码序列的方法。方法采用试剂盒离心柱法提取6种鹅膏菌DNA,以ITS4/ITS5作为丨T S序列引物和LR5/LROR作为nLSU序列的引物进行PC R扩增,后送至华大基因科技有限公司进行测序。所返回的序列进行遗传距离分析及邻接树构建。结果球基鹅膏、红托鹅膏与小豹斑鹅膏3种鹅膏菌亲缘关系较近。以丨T S序列分析,三者遗传距离在0.0202?0.0801之间。以nL SU序列分析,三者遗传距离在0.0031~0.0303之间。黄毒蝇鹅膏与赭盖鹅膏菌H 2在IT S序列中与黄毒蝇鹅膏20、21、H 7、D l、D16、D 24亲缘关系较近,遗传距离在0.0462~0.0479。赭盖鹅膏菌7与黄毒蝇鹅膏D 14两株菌遗传距离仅有0.1528。从邻接树来看ITS序列存在种内多,聚类分析结果不稳定,明显不同的2个种聚为一支。而nLSU序列可将各种分离开,结论建议鹅膏菌快速鉴定选用nLSU序列作为主要鉴定序列,IT S序列作为辅助序列。

关键词:
  • 内转录间隔区  
  • 核糖体大亚基  
  • 鹅膏菌属  
  • 系统发育  
  • 物种识别  
作者:
任翔; 杨菁; 邹颜秋颂; 杨祖顺
单位:
云南省疾病预防控制中心; 昆明650022
刊名:
食品安全质量检测学报

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食品安全质量检测学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:11-5956/TS。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于2010年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。

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