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基于生物信息学分析胰腺癌的关键基因

摘要:目的利用生物信息学分析胰腺癌发生、发展的关键基因,为胰腺癌的早期诊断、预后评估及靶向治疗提供理论依据。方法从GEO数据库中获取GSE15471基因芯片数据集,在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO、KEGG富集分析和蛋白互作网络分析,利用Cytoscape软件的cytoHubba插件筛选出关键基因,通过GEPIA数据库对关键基因再次验证。结果从GSE15471基因芯片中共筛选出267个显著差异表达基因,其中上调基因232个,下调基因35个。富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞黏附、PI 3K-Akt信号通路、蛋白水解、炎性反应、胶原分解代谢、免疫反应等。通过蛋白互作网络筛选出11个关键基因,下调基因ALB、EGF,上调基因MMP2、CXCL8、FN1、COL1A1、SPP1、MMP1、ITGA2、COL3A1、CRP。GEPIA数据库中关键基因表达情况与基因芯片分析结果一致,生存分析显示胰腺癌患者总生存时间与MMP1、ITGA2基因表达高低相关。结论生物信息学筛选出的11个关键基因在胰腺癌的发生、发展中有重要作用,是潜在的胰腺癌特异肿瘤分子学标志物和靶向治疗新位点。

关键词:
  • 生物信息学  
  • 胰腺癌  
  • 关键基因  
  • 肿瘤分子标志物  
  • 靶向治疗  
作者:
黎越; 林丹丹; 何晓琴; 徐细明
单位:
武汉大学人民医院肿瘤中心; 430060
刊名:
医学研究

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:医学研究

医学研究杂志紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:11-5453/R。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1972年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。

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