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采用SNaPshot技术对苏南地区耳聋患者进行基因突变热点筛查

摘要:目的明确苏南地区非综合征型耳聋患者7个耳聋致病基因突变热点的突变频率,验证中国人群耳聋遗传病因筛查的SNaPshot技术平台的效能。方法以125例非综合征型耳聋(non—syndromic hearing loss,NSHL)患者为研究对象,应用SNaPshot技术,针对GJB2基因235delC和299—300delAT,SLC26A4基因IVS7—2A〉G和2168A〉G,线粒体DNA(mtDNA)1555A〉G、7445A〉G和3243A〉G共7个突变热点在一个反应管中进行多重PCR后,单碱基荧光延伸标记,再采用ABI3130遗传分析仪行毛细管电泳进行基因分型,并利用直接测序和聚合酶链反应-限制性片段长度多态(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)方法验证基因分型结果。结果(1)125例样本中,GJB2基因235delC突变频率为24.0%,299-300delAT突变频率为5.6%;SLC26A4基因IVS7—2A〉G突变频率为15.2%,2168A〉G突变频率为3.2%;线粒体DNA1555A〉G突变频率为4.8%,7445A〉G突变频率为0.8%,未发现线粒体DNA3243A〉G位点突变,7个热点综合突变频率为53.6%。(2)SNaPshot结果与直接测序或PCR—RFLP结果完全吻合,检测的特异性和敏感性均为100%。结论(1)苏南地区耳聋患者7个位点突变频率超过半数;(2)用SNaPshot技术筛查耳聋基因,在一个反应管中同时检测到了7个突变热点,其检测效能高,具有临床应用价值。

关键词:
  • 非综合征型耳聋  
  • 基因筛查  
  • gjb2基因  
  • slc26a4基因  
  • 线粒体dna  
  • snapshot技术  
作者:
李红; 李海波; 毛君; 刘敏娟; 程洪波; 李士林; 陈瑛
单位:
南京医科大学附属苏州医院生殖与遗传中心; 苏州215002; 复旦大学生命科学院
刊名:
中华医学遗传学

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期刊名称:中华医学遗传学

中华医学遗传学杂志紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:51-1374/R。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1984年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。

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