《琼州学院学报》（原琼州大学学报）于1994年创刊，1998年底获准国内外公开发行，经国家新闻出版总署、国务院新闻办审核备案，为国内外公开发行刊物，是《中国期刊网》、《中国学术期刊》光盘版入编期刊，并于2003年获《CAJ-CD规范》执行优秀期刊。

《琼州学院学报》是国内统一发行的高校学报类期刊，是海南省琼南地区唯一的以教育研究为主同时兼顾其他各学科研究的综合性刊物，是进行各学科理论探索的教学、管理、技术和研究人员的科研园地。肩负着服务于数学科研、加强学术交流和推动社会主义精神文明建设的重任，服务于社会，为海南民族的经济社会发挥作用。

《琼州学院学报》现已更名为《海南热带海洋学院学报》。